D5で朝だけ数ミリの寸法ズレが発生します。使用しているとズレなくなります。

はい、エンコーダーの読み飛ばしが考えられます。不良である場合はエンコーダー(回転を読み取る装置)の交換が必要になります。詳しくはサービス課048-255-4670または、HPのお問い合わせフォームにてお気軽にお問い合わせください。